uniprot数据库包括哪些库(uniprot数据库网址)
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高通量测序数据公共数据库有哪些
1、dbEST数据库专门收集EST数据,该数据库有自己的格式,包括识别符、代码、序列数据以及dbEST的注释摘要,也按DNA的种类分成了若干子数据库。1998年5月8日版的dbEST共包括6_106条EST。
2、UniProt数据库 蛋白组学常用数据库UniProt(全称UniProt Protein Resource),建立于1986年,由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的,其信息量丰富、资源广泛,是目前公认的首选免费蛋白质数据库。
3、GEO(The NCBI Gene Expression Omnibus)是NCBI专门储存高通量测序的库。如基于芯片数据(mRNA、DNA、蛋白丰度),蛋白质质谱数据和高通量测序数据。 GEO数据主要有4种基本类型。
生物信息数据库分为哪四大类
1、收集,维护,生物信息学数据库可以分为4大类:即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子三维空间结构数据库。
2、一级核酸数据库、二级核酸数据库、蛋白质数据库一级蛋白质数据库三大类。具体如下:一级核酸数据库:存储的是通过各种科学手段得到的最直接的基础数据。如测序获得的核酸序列等。
3、基因组数据库:基因组测序 核酸序列数据库:核酸序列测定 一次数据库:蛋白质序列数据库:蛋白质序列测定。
4、按学科分类 (1)综合性检索系统:中国知网(CNKI)、万方数据、维普资源、国家图书文献中心(NSTL)、中国高等教育文献保障系统(CALIS)、中国科学引文数据库(CSCD)。
5、基因组数据库来自基因组作图,序列数据库来自序列测定,结构数据库来自X-衍射和核磁共振结构测定。这些数据库是分子生物信息学的基本数据资源,通常称为基本数据库,初始数据库,也称一次数据库。
为什么说swiss-prot是重要的蛋白质序列数据库
1、UniProt数据库 蛋白组学常用数据库UniProt(全称UniProt Protein Resource),建立于1986年,由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的,其信息量丰富、资源广泛,是目前公认的首选免费蛋白质数据库。
2、瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最大,种类最多的蛋白质组数据库。丹麦、英国、美国等也都建立了各具特色的蛋白质组数据库。
3、蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多,其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD,详见Uniprot_百度百科。
4、swiss-prot:最齐全的注释精炼的蛋白序列数据库,建立于1986年,1987年起由日内瓦大学(University of Geneva)医学生物化学系和 EMBL 数据馆(即现在的欧洲生物信息研究所EBI)共同维护。
5、除了PIR外,另一个重要的蛋白质序列数据库则是SwissProt。该数据库由瑞士日内瓦大学于1986年创建,目前由瑞士生物信息学研究所(Swiss Institute of Bioinformatics,简称SIB)和欧洲生物信息学研究所 EBI共同维护和管理。
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